|
|
| Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Las Brujas. Por información adicional contacte bibliolb@inia.org.uy. |
Registro completo
|
Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
29/09/2014 |
Actualizado : |
24/06/2021 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
FEDERICI, M.; MARCONDES, J.A.; PICCHI, S.C.; STUCHI, E.S.; FADEL, A.L.; LAIA, M.L.; LEMOS, M.V.F. |
Afiliación : |
MARIA TERESA FEDERICI RODRIGUEZ, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay. |
Título : |
Xylella fastidiosa: An in vivo system to study possible survival strategies within citrus xylem vessels based on global gene expression analysis. |
Fecha de publicación : |
2012 |
Fuente / Imprenta : |
Electronic Journal of Biotechnology, 2012, v.15, no.3, p.1-33. |
ISSN : |
0717-3458 |
DOI : |
http://dx.doi.org/10.2225/vol15-issue3-fulltext-4 |
Idioma : |
Inglés |
Contenido : |
ABSTRACT.
Xylella fastidiosa inhabits the plant xylem, a nutrient-poor environment, so that mechanisms to sense and respond to adverse environmental conditions are extremely important for bacterial survival in the plant host. Although the complete genome sequences of different Xylella strains have been determined, little is known about stress responses and gene regulation in these organisms. In this work, a DNA microarray was constructed containing 2,600 ORFs identified in the genome sequencing project of Xylella fastidiosa 9a5c strain, and used to check global gene expression differences in the bacteria when it is infecting a symptomatic and a tolerant citrus tree. Different patterns of expression were found in each variety, suggesting that bacteria are responding differentially according to each plant xylem environment. The global gene expression profile was determined and several genes related to bacterial survival in stressed conditions were found to be differentially expressed between varieties, suggesting the involvement of different strategies for adaptation to the environment. The expression pattern of some genes related to the heat shock response, toxin and detoxification processes, adaptation to atypical conditions, repair systems as well as some regulatory genes are discussed in this paper. DNA microarray proved to be a powerful technique for global transcriptome analyses. This is one of the first studies of Xylella fastidiosa gene expression in vivo which helped to increase insight into stress responses and possible bacterial survival mechanisms in the nutrient-poor environment of xylem vessels. MenosABSTRACT.
Xylella fastidiosa inhabits the plant xylem, a nutrient-poor environment, so that mechanisms to sense and respond to adverse environmental conditions are extremely important for bacterial survival in the plant host. Although the complete genome sequences of different Xylella strains have been determined, little is known about stress responses and gene regulation in these organisms. In this work, a DNA microarray was constructed containing 2,600 ORFs identified in the genome sequencing project of Xylella fastidiosa 9a5c strain, and used to check global gene expression differences in the bacteria when it is infecting a symptomatic and a tolerant citrus tree. Different patterns of expression were found in each variety, suggesting that bacteria are responding differentially according to each plant xylem environment. The global gene expression profile was determined and several genes related to bacterial survival in stressed conditions were found to be differentially expressed between varieties, suggesting the involvement of different strategies for adaptation to the environment. The expression pattern of some genes related to the heat shock response, toxin and detoxification processes, adaptation to atypical conditions, repair systems as well as some regulatory genes are discussed in this paper. DNA microarray proved to be a powerful technique for global transcriptome analyses. This is one of the first studies of Xylella fastidiosa gene expression in vivo which helped... Presentar Todo |
Thesagro : |
CITRUS; CYDIA. |
Asunto categoría : |
F01 Cultivo |
Marc : |
LEADER 02405naa a2200241 a 4500 001 1050705 005 2021-06-24 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0717-3458 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.2225/vol15-issue3-fulltext-4$2DOI 100 1 $aFEDERICI, M. 245 $aXylella fastidiosa$bAn in vivo system to study possible survival strategies within citrus xylem vessels based on global gene expression analysis.$h[electronic resource] 260 $c2012 520 $aABSTRACT. Xylella fastidiosa inhabits the plant xylem, a nutrient-poor environment, so that mechanisms to sense and respond to adverse environmental conditions are extremely important for bacterial survival in the plant host. Although the complete genome sequences of different Xylella strains have been determined, little is known about stress responses and gene regulation in these organisms. In this work, a DNA microarray was constructed containing 2,600 ORFs identified in the genome sequencing project of Xylella fastidiosa 9a5c strain, and used to check global gene expression differences in the bacteria when it is infecting a symptomatic and a tolerant citrus tree. Different patterns of expression were found in each variety, suggesting that bacteria are responding differentially according to each plant xylem environment. The global gene expression profile was determined and several genes related to bacterial survival in stressed conditions were found to be differentially expressed between varieties, suggesting the involvement of different strategies for adaptation to the environment. The expression pattern of some genes related to the heat shock response, toxin and detoxification processes, adaptation to atypical conditions, repair systems as well as some regulatory genes are discussed in this paper. DNA microarray proved to be a powerful technique for global transcriptome analyses. This is one of the first studies of Xylella fastidiosa gene expression in vivo which helped to increase insight into stress responses and possible bacterial survival mechanisms in the nutrient-poor environment of xylem vessels. 650 $aCITRUS 650 $aCYDIA 700 1 $aMARCONDES, J.A. 700 1 $aPICCHI, S.C. 700 1 $aSTUCHI, E.S. 700 1 $aFADEL, A.L. 700 1 $aLAIA, M.L. 700 1 $aLEMOS, M.V.F. 773 $tElectronic Journal of Biotechnology, 2012$gv.15, no.3, p.1-33.
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
|
Registro completo
|
Biblioteca (s) : |
INIA Tacuarembó. |
Fecha actual : |
23/09/2016 |
Actualizado : |
23/09/2016 |
Tipo de producción científica : |
Abstracts/Resúmenes |
Autor : |
VIÑOLES, C.; NICOLINI, P.; ULGUIM, R.; MEIKLE, A.; GONZÁLEZ, X. |
Afiliación : |
CAROLINA VIÑOLES GIL, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PAULA NICOLINI; RAFAEL ULGUIM; ANA MEKLE; XIMENA GONZÁLEZ. |
Título : |
Endocrinología folicular y expresión génica del complejo cumulus oocito en vacas Hereford fértiles y subfértiles. [Resumen de poster]. |
Fecha de publicación : |
2016 |
Fuente / Imprenta : |
ln: Encuentro de Investigadores de la Región Noreste: Cerro Largo-Rivera-Tacuarembó, 1., 12 de agosto de 2016, Campus Interinstitucional de Tacuarembó, Tacuarembó. Libro de Resúmenes. Tacuarembó: UDELAR; INIA, 2016. |
Páginas : |
p. 68 |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
Esta línea de investigación se genera a partir de un proyecto INIA de la Dra. Carolina Viñoles, que cuenta con 10 vacas Hereford categorizadas en fértiles y subfértiles (n=5 cada subgrupo), en base a la taza de preñez a los 24 y 73 meses de edad, y cuya estrategia de investigación buscó generar un modelo experimental de largo plazo, que permitiera evaluar las causas de infertilidad en ganado de carne. El objetivo de esta línea es desarrollar estudios de características de calidad
y funcionalidad de ovarios, folículos ováricos y complejo cúmulus-ovocito (CCO) en vacas de diferentes grados de fertilidad. Se determinarán hormonas metabólicas y esteroideas en fluido folicular y se analizará la expresión génica para función esteroidogénica y para receptores de LH e IGF1 en células granulosas (CG) y para genes que determinan viabilidad en el CCO. Para ello, se pondrán a punto metodologías de extracción de RNA a partir de muestras de CCO y CG, así como de análisis de la expresión génica en estos tejidos, mediante PCR cuantitativo en tiempo real (qPCR). La aplicación de estas metodologías en este tipo de muestras será innovadora en el Área de Reproducción Animal, no solo para Tacuarembó y la región Noreste, que es donde se implementarán, sino también para el resto de nuestro país. En el marco de esta línea de investigación se realizará una tesis de Maestría con el Proyecto: Salud reproductiva en vacas para carne: Caracterización del medio ambiente folicular y de la expresión génica en el complejo cúmulus ovocito en vacas fértiles y sub-fértiles (Programa de Posgrado de Facultad de Veterinaria, UdelaR) que será desarrollado por la estudiante Dra. Ximena González (Becaria ANII, 2015), bajo la tutoría de la Dra. Carolina Viñoles y la cotutoría de la Dra. Paula Nicolini (PDU-ISC) y el Dr. Rafael Ulguim (Brasil), en colaboración con el Dr. Bernardo Gasperin, del Laboratorio de Biotecnología y Reproducción Animal, Hospital Veterinario BioRep, Facultad de
Veterinaria, Universidad Federal de Santa María (UFSM), Río Grande do Sul (RS), Brasil. MenosEsta línea de investigación se genera a partir de un proyecto INIA de la Dra. Carolina Viñoles, que cuenta con 10 vacas Hereford categorizadas en fértiles y subfértiles (n=5 cada subgrupo), en base a la taza de preñez a los 24 y 73 meses de edad, y cuya estrategia de investigación buscó generar un modelo experimental de largo plazo, que permitiera evaluar las causas de infertilidad en ganado de carne. El objetivo de esta línea es desarrollar estudios de características de calidad
y funcionalidad de ovarios, folículos ováricos y complejo cúmulus-ovocito (CCO) en vacas de diferentes grados de fertilidad. Se determinarán hormonas metabólicas y esteroideas en fluido folicular y se analizará la expresión génica para función esteroidogénica y para receptores de LH e IGF1 en células granulosas (CG) y para genes que determinan viabilidad en el CCO. Para ello, se pondrán a punto metodologías de extracción de RNA a partir de muestras de CCO y CG, así como de análisis de la expresión génica en estos tejidos, mediante PCR cuantitativo en tiempo real (qPCR). La aplicación de estas metodologías en este tipo de muestras será innovadora en el Área de Reproducción Animal, no solo para Tacuarembó y la región Noreste, que es donde se implementarán, sino también para el resto de nuestro país. En el marco de esta línea de investigación se realizará una tesis de Maestría con el Proyecto: Salud reproductiva en vacas para carne: Caracterización del medio ambiente folicular y de la expresión génica ... Presentar Todo |
Palabras claves : |
EXPRESIÓN GÉNICA; FOLÍCULOS; OOCITO. |
Thesagro : |
VACAS. |
Asunto categoría : |
L53 Fisiología Animal - Reproducción |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/6104/1/PAGINA-68.pdf
|
Marc : |
LEADER 02968naa a2200229 a 4500 001 1055725 005 2016-09-23 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aVIÑOLES, C. 245 $aEndocrinología folicular y expresión génica del complejo cumulus oocito en vacas Hereford fértiles y subfértiles. [Resumen de poster].$h[electronic resource] 260 $c2016 300 $ap. 68 520 $aEsta línea de investigación se genera a partir de un proyecto INIA de la Dra. Carolina Viñoles, que cuenta con 10 vacas Hereford categorizadas en fértiles y subfértiles (n=5 cada subgrupo), en base a la taza de preñez a los 24 y 73 meses de edad, y cuya estrategia de investigación buscó generar un modelo experimental de largo plazo, que permitiera evaluar las causas de infertilidad en ganado de carne. El objetivo de esta línea es desarrollar estudios de características de calidad y funcionalidad de ovarios, folículos ováricos y complejo cúmulus-ovocito (CCO) en vacas de diferentes grados de fertilidad. Se determinarán hormonas metabólicas y esteroideas en fluido folicular y se analizará la expresión génica para función esteroidogénica y para receptores de LH e IGF1 en células granulosas (CG) y para genes que determinan viabilidad en el CCO. Para ello, se pondrán a punto metodologías de extracción de RNA a partir de muestras de CCO y CG, así como de análisis de la expresión génica en estos tejidos, mediante PCR cuantitativo en tiempo real (qPCR). La aplicación de estas metodologías en este tipo de muestras será innovadora en el Área de Reproducción Animal, no solo para Tacuarembó y la región Noreste, que es donde se implementarán, sino también para el resto de nuestro país. En el marco de esta línea de investigación se realizará una tesis de Maestría con el Proyecto: Salud reproductiva en vacas para carne: Caracterización del medio ambiente folicular y de la expresión génica en el complejo cúmulus ovocito en vacas fértiles y sub-fértiles (Programa de Posgrado de Facultad de Veterinaria, UdelaR) que será desarrollado por la estudiante Dra. Ximena González (Becaria ANII, 2015), bajo la tutoría de la Dra. Carolina Viñoles y la cotutoría de la Dra. Paula Nicolini (PDU-ISC) y el Dr. Rafael Ulguim (Brasil), en colaboración con el Dr. Bernardo Gasperin, del Laboratorio de Biotecnología y Reproducción Animal, Hospital Veterinario BioRep, Facultad de Veterinaria, Universidad Federal de Santa María (UFSM), Río Grande do Sul (RS), Brasil. 650 $aVACAS 653 $aEXPRESIÓN GÉNICA 653 $aFOLÍCULOS 653 $aOOCITO 700 1 $aNICOLINI, P. 700 1 $aULGUIM, R. 700 1 $aMEIKLE, A. 700 1 $aGONZÁLEZ, X. 773 $tln: Encuentro de Investigadores de la Región Noreste: Cerro Largo-Rivera-Tacuarembó, 1., 12 de agosto de 2016, Campus Interinstitucional de Tacuarembó, Tacuarembó. Libro de Resúmenes. Tacuarembó: UDELAR; INIA, 2016.
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
Registro original : |
INIA Tacuarembó (TBO) |
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
Expresión de búsqueda válido. Check! |
|
|